Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLPPQ16740 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLPPQ16740 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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