Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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