Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACKR1Q16570 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms