Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPC1Q16533 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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