Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CNGA3Q16281 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms