Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF1AQ15573 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms