Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDSNQ15517 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDSNQ15517 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDSNQ15517 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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CDSNQ15517 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDSNQ15517 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDSNQ15517 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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