Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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SYCP1Q15431 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SYCP1Q15431 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SYCP1Q15431 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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SYCP1Q15431 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYCP1Q15431 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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