Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NCF4Q15080 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms