Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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CNGB1Q14028 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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CNGB1Q14028 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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