Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
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SHROOM2Q13796 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SHROOM2Q13796 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
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SHROOM2Q13796 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
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SHROOM2Q13796 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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SHROOM2Q13796 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
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SHROOM2Q13796 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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SHROOM2Q13796 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
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SHROOM2Q13796 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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SHROOM2Q13796 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
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