Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTCH1Q13635 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTCH1Q13635 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
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