Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3BQ13214 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms