Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GRIK3Q13003 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK3Q13003 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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