Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FOXD4Q12950 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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