Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRJQ12913 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms