Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CNTN1Q12860 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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