Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SREBF2Q12772 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SREBF2Q12772 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms