Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAPQ12770 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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