Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC15Q0P6D6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms