Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SSRP1Q08945 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms