Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms