Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSME1Q06323 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.4 ms