Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms