Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAV1Q03135 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms