Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms