Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FGD1P98174 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FGD1P98174 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FGD1P98174 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
FGD1P98174 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FGD1P98174 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms