Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
HERVK_113P63121 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms