Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HERVK_113P62684 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HERVK_113P62684 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms