Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS3AP61247 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms