Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms