Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP6P55212 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP6P55212 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP6P55212 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP6P55212 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP6P55212 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP6P55212 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP6P55212 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms