Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP9P55211 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CASP9P55211 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP9P55211 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms