Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A1P53007 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms