Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSRP3P50461 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms