Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTPAP49638 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTPAP49638 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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