Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms