Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms