Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCSK1P29120 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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