Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHATP28329 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHATP28329 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHATP28329 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHATP28329 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHATP28329 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHATP28329 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CHATP28329 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHATP28329 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHATP28329 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms