Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ABCD3P28288 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms