Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PLNP26678 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PLNP26678 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PLNP26678 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PLNP26678 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PLNP26678 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PLNP26678 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PLNP26678 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PLNP26678 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PLNP26678 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms