Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRBP23467 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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