Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYT1P21579 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYT1P21579 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYT1P21579 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYT1P21579 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms