Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNNI3P19429 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms