Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VCLP18206 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VCLP18206 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VCLP18206 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VCLP18206 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms