Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms