Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTLA4P16410 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTLA4P16410 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms