Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRAFP15056 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRAFP15056 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRAFP15056 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms