Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A1P11836 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms